离子色谱仪高压将流动相以稳定的流速输送至分析体系，在色谱柱之前通过进样器将样品导入，流动相将样品带入色谱柱，在色谱柱中各组分被分离，并依次随流动相流至检测器。

抑制型离子色谱则在电导检测器之前增加一个抑制系统，即用另一个高压将再生液输送到抑制器。
在抑制器中，流动相背景电导被降低，然后将流动出物导入电导池，检测到的信号送至数据处理系统记录、处理或保存。
非抑制型离子色谱仪不用抑制器和输送再生液的高压泵，结构相对比较简单，价格也相对比较便宜。
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