往复式摇床是左右振荡，表层和空气接触面大，单次处理量小，混匀效果比较好；往复振荡可以更大限度的与氧气接触，增加菌种的含氧量，提高生长速度与成活率；但是培养的容量不能过多，过多会使底部的菌种得不到良好生长，单次处理量大的话，底层菌种会缺氧，混匀效果欠佳。

回旋式摇床的混匀效果比较好，内部营养物质上下均匀；回旋振荡可以使沉淀在培养皿下面的培养物质与菌种可以上下浮动，保证上下的菌种生长速度一致；但是与空气接触截面小，部分菌种可能会缺氧。

所以摇床一定要根据自己的需求去选择。